自动存包柜企业投入资金不足，创新人才匮乏。自动存包柜企业创新需要大量的人力财力支持，而中国自动存包柜企业目前投入到研发方面的资金却严重不足，相比于发达国家对自动存包柜方面的投入而言太少。资金投入不足必然会导致自动存包柜技术以及生产方面的创新不够，进而影响自动存包柜企业长期生存发展。
与此同时，人才也是自动存包柜创新发展的一大缺陷，由于当前我国自动存包柜相关人才构成不合理，自动存包柜企业极其缺乏高层次创新人才。人才是自动存包柜企业创新的关键，长期以来，由于中国高校培养体制和自动存包柜企业招聘体制方面的不足，自动存包柜企业面临着创新人才的缺乏，没有人才，自动存包柜企业创新必然无法进行。
自动存包柜企业创新制度缺乏，内部管理落后。自动存包柜企业的创新不仅是个技术问题，也是个制度和自动存包柜方面的管理问题。自动存包柜企业的创新需要有完善合理的制度来保护和支持。
当前中国大多数自动存包柜企业仍然面临着产权不明晰，并且自动存包柜制度不完善和管理落后的问题。自动存包柜企业在缺乏现代管理制度的情况下，领导层的风格将直接决定自动存包柜企业的发展方向。
而当没有与自动存包柜创新相匹配的激励制度、自动存包柜人才引进制度等内部制度保障时，自动存包柜企业创新更容易受到领导风格影响。当自动存包柜产品设计时风格趋于保守时，自动存包柜企业创新就会受限。
自动存包柜企业合作创新不足，忽视市场需求。创新最终能否创造经济价值是自动存包柜企业十分关注的，而这必须通过市场来检验。据发现，当前自动存包柜企业创新主要由自动存包柜企业自主独立完成，较少与高校和科研机构进行沟通合作。
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